Le système racinaire des céréales une cible pour l’amélioration variétale ?

Besoin d'aide ?

(Nombre de téléchargements - 0)

Catégorie :

Pour des questions et des demandes, contactez notre service d’assistance E-mail : [email protected]

Table des matières

Introduction
1. Synthèse bibliographique
1.1. Le système racinaire des céréales
1.1.1. Architecture du système racinaire
1.1.2. Interaction racines – sol – microbiome : la rhizosphère
1.1.3. Le système racinaire des céréales : une cible pour l’amélioration variétale ?
1.2. Le mil
1.2.1. Biologie de la plante
1.2.2. Origine et domestication
1.2.3. Importance économique et sociale
1.2.4. Facteurs limitants la production du mil
1.3. Problématique du stage
2. Matériels et méthodes
2.1. Matériel végétal
2.2. Génotypage par séquençage
2.3. Modélisation de QTL : Bulk Segregant Analysis (BSA)
2.3.1. Simulation de la population F2
2.3.2. Analyses statistiques
2.4. Evaluation de l’homogénéité des lignées BC2F4
2.4.1. Diversité phénotypique de la croissance racinaire précoce des lignées BC2F4
2.4.2. Diversité génétique des lignées BC2F4
2.5. Analyse statistique des données
3. Résultat
3.1. Modélisation de QTLs : Analyse de ségrégation en masse (Bulk Segregant Analysis ou BSA)
3.1.1. Impact de la variation de qtl effect sur la précision d’estimation de la position de QTL
3.1.2. Impact de la variation du nombre d’individus d’une population en fonction de l’effet QTL
3.2. Analyses de lignées recombinantes fixées
3.2.1. Analyse de l’homogénéité génétique des lignées
3.2.2. Analyse de l’homogénéité phénotypique des lignées
4. Discussion 
Conclusion

PAR : Princia Aurore Biawallys NAKOMBO-GBASSAULT

Sigles et acronymes

ANOVA : Analysis of variance (Analyse de variance)
BSA : Bulk segregant Analysis (Analyse de ségrégation en masse)
FAO: Food and Agriculture Organization of the United Nations (l’Organisation des Nations unies pour l’alimentation et l’agriculture)
GBS: Genotyping by sequencing (Génotypage par séquençage)
GWAS : Genome wide association study (étude de génétique d’association)
ICRISAT: Institut internationale de recherche sur les cultures des zones tropicales semi-arides
PCR : Polymerase Chain Reaction (réaction de polymérisation en chaîne par polymérase)
QTL : Quantitative trait loci (locus de caractère quantitatif)
SNP : Single nucleotid polymorphism (polymorphisme nucléotidique)
RIL: recombinant inbred line (lignée recombinante fixée)

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *