Écologie des prédateurs et du guano

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Par : Jérémy Rollin

Table des matières

Introduction
Partie 1 : Cadre de l’étude
1. État de l’art : Paléoentomologie et archéoentomologie
1.1 Objectifs des études archéoentomologiques : Rappels généraux.
1.2 La paléoentomologie environnementale : Définition et généralité
2. Généralités, Géologie et Géomorphologie de la Nouvelle-Calédonie
3. Le climat et ses fluctuations en Nouvelle-Calédonie
3.1 Année neutre (sans le Mode ENSO)
3.2 Année touchée par le Mode ENSO
3.2.1 El Niño
3.2.2 La Niña
4. Biodiversité de la Nouvelle-Calédonie
4.1 La flore et les principales formations végétales
4.2 L’entomofaune
5. Écologie des prédateurs et du guano
5.1 Salanganes diurnes
5.2 Les chiroptères nocturnes
5.3 Le guano : un écosystème à part entière
6. État de l’art: prélèvement et analyses multiproxies (Projet Guacamolé et CAID)
6.1 Chronologie du sondage
6.2 Données palynologiques
6.3 Données isotopiques
Partie 2 : Matériels et méthodes.
1. Provenance du matériel et stratégies d’analyses
2. Traitement et extraction de la fraction entomologique
3. Détermination des restes d’insectes
3.1 Systématique et taxonomie
3.1.1 Méthode de détermination
3.1.2 Quantification de la fraction entomologique
3.2 Infrarouge
3.2.1 Choix de la méthode
3.2.2 Équipements et paramètres
3.2.3 Matériel à analyser et préparation
3.2.4 Traitement statistique des données infrarouges
3.3 Analyses moléculaires
3.3.1 Test du pH pour analyse ADN
3.3.2 Choix du marqueur moléculaire et recherche d’amorces
3.3.3 Protocole d’extraction
3.3.4 Quantification d’ADN total
3.3.5 Profil de dégradation
3.3.6 Amplification PCR
3.3.7 Purification ADN
3.3.8 Séquençage d’ADN par NGS
Partie 3 : Résultats
1. Analyse granulométrique
2. Taxonomie
2.1 Taxons en présence
2.2 Spectres taxonomiques globaux
2.2.1 HAK1 1-2
2.2.2 HAK1 12-13
2.2.3 HAK1 22-23
2.2.4 HAK1 32-33
2.2.5 HAK1 42-43
2.2.6 HAK1 51-52
2.2.7 HAK1 62-63
2.2.8 HAK1 71-72
2.2.9 HAK1 82-83
2.2.10 HAK1 91-92
2.3 Traitement des données
2.3.1 Traitements statistiques sur les assemblages entomologiques
2.3.1.1 Hymenoptera
2.3.1.1.1 Formicidae
2.3.1.1.2 Chalcidoidae
2.3.1.2 Coleoptera
2.3.2 Comparaison avec l’ensemble des proxies environnementaux
2.3.2.1 Statistiques multivariées sur l’ensemble des données
2.3.2.2 Synthèse de l’information biologique
2.3.2.3 Matrice de données paléoenvironnementales : comparaison des proxies
3. Données de spectroscopie infrarouge (SWIR)
4. Résultats des analyses moléculaires.
Partie 4 : Interprétations et discussions
1. Influence des évènements naturels et anthropiques sur les cortèges d’insectes
1.1 Réponses des insectes aux phases du Mode ENSO
1.2 Réponses des insectes face aux périodes de floraison et aux changements anthropiques
2. Des restes d’insectes dans le guano fossile ? Potentiel de la paléoentomologie en contexte karstique tropical au Quaternaire. Exemple de la grotte Tabon (Palawan, Philippines)
Conclusion

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