Soutenance mémoire
LA PRODUCTION DE POULET
Les affections respiratoires virales du poulet
Principaux virus respiratoires aviaires
La diversité des agents pathogènes et l’influence de facteurs techniques font de la pathologie respiratoire des volailles une entité complexe étudier. Les virus tropisme respiratoire font partie de cette entité. Ils sont nombreux mais peu ont eux seuls un réel impact sur la santé des volailles. Cinq virus principaux ont une importance dominante dans les maladies respiratoires des volailles :
Le virus de la maladie de Newcastle (NDV)
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
Le virus de linfluenza aviaire (AIV)
Le virus de la laryngotrachéite infectieuse (ILTV)
Le virus de la rhinotrachéite infectieuse ou métapneumovirus aviaire (aMPV)
En se basant sur la littérature, nous avons fait le choix de ne retenir que les 4 premiers virus, pour notre étude de prévalence en Afrique de l’ouest. Les virus IBV et NDV engendrent le plus de pertes sur le terrain et nous avons donc ciblé leur caractérisation pour la suite de notre travail. C’est pourquoi nous allons les exposer de faon plus précise.
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
La bronchite infectieuse est une maladie infectieuse, trŁs contagieuse, causée par un coronavirus, le virus de la bronchite infectieuse (IBV). C’est une maladie qui a une importance Øconomique majeure car elle peut provoquer des retards de croissance, une baisse de la production et de la qualité des oeufs et une augmentation de la mortalité Sa première description remonte 1930 aux Etats-Unis [2], [3].
Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
LIBV appartient la famille des Coronaviridae. Cette famille comprend deux genres, les Coronavirus et les Torovirus. LIBV fait partie du groupe 3 du genre Coronavirus,maintenant nommØ Gammacoronavirus.Ce groupe englobe pour l’essentiel des coronavirus aviaires. Les coronavirus des groupes alpha et béta, quant- eux, comprennent les coronavirus des mammifŁres. Les deltacoronavirus regroupent des virus aviaires et de mammifères.LIBV est un virus enveloppé, ARN simple brin, de polarité positive. Son enveloppe a un diamètre de 120 nanomŁtres. Quatre protØines structurales jouent un rle majeur (Figure 1a et 1b) :
– La protéine de la spicule (S) : la protéine S est une glycoprotéine, de 180 KDa. Elle se présente sous forme de dimŁre ou de trimŁre. Elle a deux fonctions majeures :
lattachement du virus aux cellules de lhte et la fusion de la membrane virale la membrane des cellules htes [2], [4], [6]. La protéine S est formØe de deux sous unités, les glycoprotéines S1 et S2. La glycoprotéine S1 est responsable du pouvoir dhémagglutination et de linduction danticorps neutralisants protecteurs. La glycoprotéine S2 permet lencrage de S dans la membrane du virus .
– La glycoprotéine de la membrane (M) : la protéine M est une glycoprotéine hydrophobe partiellement exposØe la surface du virion, de masse moléculaire comprise entre 27 et 36 KDa. Cette protéine est la proéine structurale la plus abondante. Elle joue un rle essentiel dans lassemblage et le bourgeonnement des particules virales.
– La nucléocapside (N) : la nucléoprotéine N est une protéine phosphorylée, hautement basique de 52 KDa [9]. Elle est étroitement liée la molécule dARN du génome et forme une nuclØocapside de symétrie hélicodale. Une région de cette protéine est bien conservée chez les différentes souches dIBV. Elle jouerait un rle dans la transcription et probablement dans la traduction de lARN viral .
– La protéine de l’enveloppe (E) : la protéine E est une protéine hydrophobe,transmembranaire, non glycosylée, de petite taille et intégrée l’enveloppe virale. Elle joue un role essentiel dans lassemblage et le bourgeonnement des particules virales .L’organisation du génome de lIBV présente certaines similitudes avec les autres membres du genre Coronavirus :
– Un gène codant pour la polymØrase (ou gŁne 1) qui reprØsente les 2/3 du génome,partir de la région 5 terminale : il contient deux cadres de lecture (ORF), 1a et 1b(Figure 2), qui codent pour une polyprotéine fusionnée 1ab, indispensable la réplication
– Des gènes codant pour les protéines structurales (S, E, M et N)
– Deux gènes (codant pour des protéines non essentielles la réplication mais probablement essentielles dans léchappement la réponse immunitaire de lhte.
Formes cliniques de la bronchite infectieuse
Initialement, la bronchite infectieuse (BI) aviaire était décrite comme une atteinte respiratoire des jeunes poulets. Ce n’est que plus tard quelle fut décrite sur des animaux plus gés, notamment chez les poules pondeuses.
Les signes cliniques sont souvent frustres, mais un poulet atteint de BI peut presenter :
– une atteinte respiratoire : détresse respiratoire, toux, reniflement, roles tracheaux, yeux qui pleurent
– une atteinte de l’état général : anorexie, retard de croissance, animaux déprimés – dans de rares cas, une atteinte rénale : fèces humides, dépression Les poules pondeuses atteintes dIBV, quant elles, présentent une chute de ponte, avec des œufs « fripés » la coquille fine. Les poules peuvent également avoir des lésions au niveau de loviducte [2], [3]. Des souches IBV variantes peuvent provoquer une atrésie de l’appareil génital femelle lorsque linfection virale est trŁs précoce (moins de 3 semaines dge) : cette infection précoce aboutit la formation de kystes. Les poules atteintes sont dites « fausses pondeuses » car si elles ne présentent aucun signe clinique particulier, elles ne seront jamais capables de pondre.
Les souches dIBV
LIBV a été pour la première fois isolé au Massachussetts, dans les années 1930 et pendant de nombreuses années, le sérotype Mass fut le seul sérotype dIBV connu [12]. On compte maintenant une dizaine de sØrotypes et un nombre bien plus élevé de génotypes. La distinction génétique et antigénique entre souches dIBV est complexe et ne correspond pas aux protectotype (une souche dun sérotype ou d’un génotype donné ne protègera pas forcément contre une autre souche de ce mŒme sérotype/génotype) [14][16]. Les souches en circulation dans le monde sont résumées dans le tableau 3 .
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Guide du mémoire de fin d’études avec la catégorie LES AFFECTIONS RESPIRATOIRES VIRALES DU POULET |
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Table des matières
REMERCIEMENTS
DEDICACES
LISTE DES FIGURES
LISTE DES TABLEAUX
LISTE DES ABREVIATIONS
INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE : PRODUCTION ET MALADIES RESPIRATOIRES DU POULET EN AFRIQUE DE LOUEST
1. LA PRODUCTION DE POULET EN AFRIQUE DE LOUEST
1.1. PRODUCTION AVICOLE DANS LUEMOA (UNION ECONOMIQUE ET MONETAIRE OUEST AFRICAINE)
1.2. PRODUCTION AVICOLE AU TOGO, AU BENIN ET EN COTE DIVOIRE
2. LES AFFECTIONS RESPIRATOIRES VIRALES DU POULET
2.1. PRINCIPAUX VIRUS RESPIRATOIRES AVIAIRES
2.2. LE VIRUS DE LA BRONCHITE INFECTIEUSE (IBV)
2.2.1. Le virus de la bronchite infectieuse (IBV)
2.2.2. Formes cliniques de la bronchite infectieuse
2.2.3. Les souches dIBV
2.2.4. EpidØmiologie de la bronchite infectieuse dans le monde et en Afrique
2.3. LE VIRUS DE LA MALADIE DE NEWCASTLE (NDV)
2.3.1. Etiologie de NDV
2.3.2. Formes cliniques de la maladie de Newcastle
2.3.3. Souches virales de NDV
2.3.4. EpidØmiologie de NDV dans le monde et en Afrique
DEUXIEME PARTIE : ETUDES EXPERIMENTALES
1. ETUDE DE LA PREVALENCE DIBV, NDV, ILTV ET AIV AU TOGO ET AU BENIN EN 2011
1.1. MATERIELS ET METHODES
1.1.1. Extraction dADN/ARN
1.1.2. (RT)-PCR
1.1.2.1. PrØsentation
1.1.2.2. Application
1.2. RSULTATS
1.3. DISCUSSION
2. EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DE SOUCHES IVOIRIENNES DU VIRUS DE LA MALADIE DE NEWCASTLE
2.1. MATERIELS ET METHODES
2.1.1. PCR de contrle
2.1.2. Purification
2.1.3. SØquenage
2.2. RESULTATS
2.3. DISCUSSION
3. EVALUATION DE LEFFICACITE DU VACCIN H120 CONTRE UNE SOUCHE AFRICAINE DU VIRUS DE LA BRONCHITE INFECTIEUSE
3.1. MATERIELS ET METHODES
3.1.1. Amplification du virus sur ufs embryonnØs
3.1.1.1. Infection
3.1.1.2. RØcolte du liquide allantoque
3.1.2. Etude vaccinale
3.1.2.1. Formation des lots
3.1.2.2. Infection et Øcouvillonnages
3.1.2.3. (RT)-PCRq
3.1.2.4. SØrologie
3.2. RESULTATS
3.3. DISCUSSION
CONCLUSION
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANNEXE 1 : POSTER SYMPOSIUM TOULOUSE-MUNICH-SARRAGOSSE 2013
ANNEXE 2 : AVIAN INFLUENZA SURVEILLANCE IN CENTRAL AND WEST AFRICA, 20102014, T. Fuller and al. 2014
ANNEXE 3 : PREVALENCE OF NEWCASTLE DISEASE VIRUS AND INFECTIOUS BRONCHITIS VIRUS IN AVIAN INFLUENZA NEGATIVE BIRDS FROM LIVE BIRD MARKETS AND BACKYARD AND COMMERCIAL FARMS IN IVORY-COAST, A. V. Kouakou and al. 2015
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