Soutenance mémoire
Stratégie d’échantillonnage de Donax trunculus
La collecte de Donax trunculus est effectuée à l’aide d’un râteau à main, couramment utilisés pour la pêche des mollusques, appelé communément « cope ou tellinier » ; cet outil comporte deux parties ; une métallique composée de deux arceaux réunis et d’une tôle dentée sous forme de peigne armé de longues dents en fer, l’autre partie est constituée d’un filet dont le maillage ne doit pas être inférieur à 10 mm. Le râteau est pourvu d’un poignet de 1,5 m de long, ce qui permet de régler l’inclinaison des dents (Fig. 9).
L’échantillonnage est réalisé mensuellement pendant une période d’un an (Janvier – décembre 2015) au niveau des trois sites d’étude (El Battah, Echatt et Sidi Salem). Un nombre de 100 individus sont pêchés mensuellement et d’une façon aléatoire au niveau de chaque site à une profondeur d’environ 1,50 m. Les échantillons sont ensuite transportés au laboratoire dans des bacs en plastiques contenant de l’eau de mer. L’étude biométrique, la dissection et le prélèvement du manteau, glandes digestives et des gonades sont réalisés le jour même de la pêche pour éviter l’effet du jeûne et une émission éventuelle des gamètes due au stress ; ce qui induit une diminution du poids de la masse molle totale (Beninger & Lucas, 1984).
Biométrie et croissance de Donax trunculus
Les individus de D. trunculus sont mesurés à l’aide d’un pied à coulisse (précision 1/10 mm) et classés selon la longueur de l’axe antéropostérieur de leur coquille ; ce qui correspond à la longueur totale (L). D’autres paramètres linéaires sont considérés durant cette étude telles que ; la hauteur (H) qui va de la charnière dorsale au bord ventral et l’épaisseur (E) qui est la largeur maximale de la convexité des deux valves réunies (Fig. 10). Une fois mesurés, les individus sont répartis selon leur longueur en classes de tailles d’une amplitude de 2 mm (Sifi, 2007). Puis, le nombre d’individus par classe de taille est calculé afin d’étudier l’effectif et la fréquence des classes par mois et par site.
Indice de condition et indice gonadosomatique
– L’indice de condition (IC) : représente le premier indicateur du taux de remplissage de la coquille par les tissus mous, ainsi que les variations saisonnières des réserves nutritives et de la qualité des tissus. Il existe plusieurs formules pour le calcul de l’indice de condition (IC), notre choix s’est porté sur la formule suivante selon Lucas & Beninger (1985):
IC= (Poids sec de la chaire / Poids sec de la coquille) X 100
Poids : en g.
– L’indice gonado-somatique (IGS) : traduit l’importance relative de la masse de la glande sexuelle par rapport à celle de l’ensemble des chairs de l’animal frais, et reflète donc son état vis-à-vis du cycle de reproduction (Breau et al., 2011) :
IGS = (Poids frais de la gonade / Poids total frais de la chair) X 100
Poids : en g.
Les paramètres pondéraux ont été déterminés à l’aide d’une balance de précision (Sartorius H110, précision 0,1 mg).
Transplantation
L’expérience de transplantation
Donax trunculus est un bivalve suspensivore vivant dans les sédiments. Les échantillons ont été prélevés selon la méthode de collecte déjà décrite par Hafsaoui et al. (2016) cette méthode consiste à utiliser un râteau à main communément appelé «cope» constitué d’une armature métallique et d’un filet de 5 mm (Fig. 9). L’échantillonnage a été réalisé sur deux sites distants d’environ 20 km dans le golfe d’Annaba (fig. 11). Sidi Salem (36°50’N – 7°47’E) un site contaminé situé dans le secteur Ouest du golfe près de l’estuaire de la Seybouse, exposé à divers rejets d’origine domestique, agricole et industrielle (Abdennour et al., 2000 ; Soltani et al., 2012 ; Ounissi et al., 2016 ; Belabed et al., 2017). Le deuxième site El Battah (36°50’N – 8°50’E), situé dans la partie orientale du golfe d’Annaba près de l’estuaire de Mafrag est considéré comme un site relativement propre loin des sources de pollution et exploité par la pêche. Ce site est également caractérisé par des conditions hydrodynamiques plus intenses qui peuvent contribuer à la dilution des polluants. D. trunculus a été prélevé au hasard sur le site contaminé de Sidi Salem, transporté (30-35 min) dans des récipients en plastique contenant de l’eau de mer dans des conditions ambiantes jusqu’à la plage El Battah pour être transplanté. Un nombre de 100 individus (longueur de coquille 27 ± 1,52 mm) sont transplantés dans deux cages (60 x 60 x 60 cm avec un maillage de 2 mm) remplis d’un fond sableux et immergées à une profondeur de 1 et 2 m pendant 21 jours en été. Des tests biochimiques ont été effectués à divers moments (0, 7, 14 et 21 jours) pendant la période de transplantation.
|
Table des matières
INTRODUCTION
CHAPITRE I : MATÉRIEL ET MÉTHODES
1. Présentation, Morphologie et Anatomie de Donax trunculus
2. Répartition géographique
3. Biotope
4. Nutrition
5. Distribution spatiale
6. Reproduction et développement
7. Distinction des sexes
8. Caractéristiques des sites d’échantillonnage
8.1. Golfe d’Annaba
8.2. Site d’El Battah
8.3. Site d’Echatt
8.4. Site de Sidi Salem
9. Stratégie d’échantillonnage de Donax trunculus
10. Biométrie et croissance de Donax trunculus
11. Indice de condition et indice gonadosomatique de Donax trunculus
12. Transplantation
12.1. Expérience de transplantation
12.2. Collecte des échantillons de transplantation
13. Dissection et prélèvement des tissus
13.1. Dissection et prélèvement des manteaux
13.2. Dissection et prélèvement des gonades
13.3. Dissection et prélèvement des glandes digestives
14. Dosage des biomarqueurs du stress environnemental
14.1. Dosage de l’acétylcholinestérase (AChE)
14.2. Dosage de la glutathion S-transférase (GST)
14.3. Dosage des protéines
14.4. Technique d’extraction et dosage des métallothionéines
14.4.1. Préparation de la fraction enrichie en métallothionéines
14.4.2. Dosage des métallothionéines
14.5. Dosage qualitatif des acides gras
14.6. Dosage du Glycogène
15. Analyses statistiques
CHAPITRE II : RÉSULTATS
1. Etude de la distribution des fréquences de taille
2. Etude de la Biométrie et de la croissance
3. Etude des indices biologique (Indice de condition et indice gonadosomatique)
3.1. Indice de condition (IC)
3.2. Indice gonadosomatique (IGS)
4. Variations spatio-temporelles des biomarqueurs du stress environnemental
4.1. Activité enzymatique de l’acétylcholinestérase (AChE)
4.2. Activité de la glutathion S transférase (GST)
4.3. Taux de métallothionéines
4.4. Taux du Glycogène
5. Mesure des biomarqueurs du stress environnemental durant la période de transplantation
5.1. Activité enzymatique de l’acétylcholinestérase (AChE)
5.2. Activité de la glutathion S transférase (GST)
5.3. Taux de métallothionéines
5.4. Dosage des acides gras
5.4.1. Composition des acides gras
5.4.2. Activités désaturases et les enzymes de type élongase
5.5. Dosage du Glycogène
CHAPITRE III : DISCUSSION
1. Dynamique des populations
2. Les indices biologiques (indice de condition et indice gonadosomatique)
2.1. Indice de condition
2.2. Indice gonadosomatique
3. Réponse des biomarqueurs du stress environnemental
3.1. L’acétylcholinestérase
3.2. La glutathion S-transférase
3.3. Les métallothionéines
4. Composition biochimique
4.1. Glycogène
5. Transplantation
5.1. Acétylcholinestérase
5.2. Glutathion S-transférase
5.3. Métallothionéines
5.4. Glycogène
5.5. Acides gras
VI. CONCLUSION
RÉSUMÉS
Français
Anglais
Arabe
RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
ANNEXES
